Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a3bpQ9EQG9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms