Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmigd1Q9D7L8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Tmigd1Q9D7L8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Tmigd1Q9D7L8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmigd1Q9D7L8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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