Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip1Q9D620 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip1Q9D620 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms