Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhdc8bQ9D2D9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhdc8bQ9D2D9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhdc8bQ9D2D9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms