Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SarnpQ9D1J3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarnpQ9D1J3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SarnpQ9D1J3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms