Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stx17Q9D0I4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx17Q9D0I4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx17Q9D0I4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms