Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa9Q9CZN4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisa9Q9CZN4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms