Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mgme1Q9CXC3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Mgme1Q9CXC3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mgme1Q9CXC3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms