Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atxn3Q9CVD2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atxn3Q9CVD2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atxn3Q9CVD2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms