Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspo2Q9CRZ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tspo2Q9CRZ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspo2Q9CRZ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms