Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc96Q9CR92 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc96Q9CR92 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms