Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh23Q99PF4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh23Q99PF4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh23Q99PF4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh23Q99PF4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh23Q99PF4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh23Q99PF4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh23Q99PF4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh23Q99PF4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh23Q99PF4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh23Q99PF4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh23Q99PF4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms