Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SrrtQ99MR6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrtQ99MR6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrrtQ99MR6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms