Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SmagpQ99KC7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmagpQ99KC7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmagpQ99KC7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmagpQ99KC7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms