Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd1bQ99JY6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms