Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf3Q922U1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf3Q922U1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf3Q922U1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms