Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rrp1bQ91YK2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rrp1bQ91YK2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms