Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnot6lQ8VEG6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnot6lQ8VEG6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot6lQ8VEG6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cnot6lQ8VEG6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot6lQ8VEG6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms