Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sf3b4Q8QZY9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sf3b4Q8QZY9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sf3b4Q8QZY9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 335.5 ms