Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc28bQ8CEG5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms