Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe22Q8C6A8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe22Q8C6A8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bhlhe22Q8C6A8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe22Q8C6A8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms