Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubqln3Q8C5U9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubqln3Q8C5U9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubqln3Q8C5U9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubqln3Q8C5U9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubqln3Q8C5U9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubqln3Q8C5U9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ubqln3Q8C5U9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Ubqln3Q8C5U9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Ubqln3Q8C5U9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubqln3Q8C5U9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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