Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmo3Q8BZL8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmo3Q8BZL8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmo3Q8BZL8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms