Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cc2d1bQ8BRN9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cc2d1bQ8BRN9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms