Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV8

A530064D06Rik, Plasmacytoid dendritic cell-specific receptor, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530064D06RikQ8BNV8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms