Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV8

A530064D06Rik, Plasmacytoid dendritic cell-specific receptor, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530064D06RikQ8BNV8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A530064D06RikQ8BNV8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530064D06RikQ8BNV8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms