Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4dQ8BGV9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4dQ8BGV9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms