Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna12Q80SS5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna12Q80SS5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms