Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek5Q7TSC3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek5Q7TSC3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek5Q7TSC3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms