Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed3Q78IS1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed3Q78IS1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed3Q78IS1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms