Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Casc1Q6TDU8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casc1Q6TDU8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casc1Q6TDU8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms