Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rundc3bQ6PDC0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3bQ6PDC0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc3bQ6PDC0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms