Protein–RNA interactions for Protein: Q61333

Tnfaip2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip2Q61333 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfaip2Q61333 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfaip2Q61333 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfaip2Q61333 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfaip2Q61333 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms