Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfap2bQ61313 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfap2bQ61313 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tfap2bQ61313 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap2bQ61313 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms