Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf3Q60803 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3Q60803 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf3Q60803 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3Q60803 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms