Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mkrn3Q60764 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mkrn3Q60764 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms