Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trappc1Q5NCF2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc1Q5NCF2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc1Q5NCF2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms