Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q504N7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q504N7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q504N7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q504N7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q504N7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q504N7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q504N7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q504N7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q504N7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q504N7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q504N7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q504N7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q504N7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q504N7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q504N7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q504N7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q504N7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q504N7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q504N7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q504N7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q504N7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q504N7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q504N7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q504N7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q504N7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q504N7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q504N7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q504N7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q504N7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q504N7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q504N7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q504N7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q504N7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q504N7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q504N7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q504N7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q504N7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q504N7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q504N7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q504N7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q504N7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q504N7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q504N7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q504N7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q504N7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q504N7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q504N7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q504N7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q504N7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q504N7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q504N7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q504N7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q504N7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q504N7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q504N7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q504N7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q504N7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q504N7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q504N7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q504N7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q504N7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q504N7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q504N7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q504N7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q504N7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q504N7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q504N7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q504N7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q504N7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q504N7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q504N7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q504N7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q504N7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q504N7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q504N7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q504N7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q504N7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q504N7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q504N7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q504N7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q504N7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q504N7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q504N7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q504N7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q504N7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q504N7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q504N7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q504N7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q504N7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q504N7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q504N7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q504N7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q504N7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q504N7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q504N7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q504N7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q504N7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q504N7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q504N7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms