Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samt2Q497M0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samt2Q497M0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Samt2Q497M0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms