Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Carmil2Q3V3V9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Carmil2Q3V3V9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms