Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc110Q3V125 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc110Q3V125 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms