Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ankrd27Q3UMR0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd27Q3UMR0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ankrd27Q3UMR0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms