Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mccc2Q3ULD5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mccc2Q3ULD5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms