Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp36Q3UFY0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp36Q3UFY0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp36Q3UFY0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms