Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc10Q3TLI0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trappc10Q3TLI0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc10Q3TLI0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms