Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeblQ0II04 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NeblQ0II04 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeblQ0II04 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeblQ0II04 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeblQ0II04 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms