Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
rp9P97762 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
rp9P97762 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
rp9P97762 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
rp9P97762 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
rp9P97762 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
rp9P97762 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
rp9P97762 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
rp9P97762 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
rp9P97762 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
rp9P97762 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
rp9P97762 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
rp9P97762 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
rp9P97762 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
rp9P97762 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
rp9P97762 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
rp9P97762 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
rp9P97762 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
rp9P97762 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
rp9P97762 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
rp9P97762 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
rp9P97762 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
rp9P97762 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
rp9P97762 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
rp9P97762 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
rp9P97762 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
rp9P97762 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
rp9P97762 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
rp9P97762 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
rp9P97762 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
rp9P97762 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
rp9P97762 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
rp9P97762 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
rp9P97762 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
rp9P97762 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
rp9P97762 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
rp9P97762 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
rp9P97762 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
rp9P97762 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
rp9P97762 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
rp9P97762 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
rp9P97762 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
rp9P97762 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
rp9P97762 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
rp9P97762 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
rp9P97762 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
rp9P97762 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
rp9P97762 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
rp9P97762 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
rp9P97762 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
rp9P97762 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
rp9P97762 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
rp9P97762 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
rp9P97762 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
rp9P97762 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
rp9P97762 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
rp9P97762 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
rp9P97762 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
rp9P97762 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
rp9P97762 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
rp9P97762 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
rp9P97762 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
rp9P97762 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
rp9P97762 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
rp9P97762 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
rp9P97762 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
rp9P97762 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
rp9P97762 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
rp9P97762 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
rp9P97762 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
rp9P97762 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
rp9P97762 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
rp9P97762 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
rp9P97762 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
rp9P97762 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
rp9P97762 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
rp9P97762 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
rp9P97762 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
rp9P97762 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
rp9P97762 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
rp9P97762 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
rp9P97762 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
rp9P97762 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
rp9P97762 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
rp9P97762 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
rp9P97762 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
rp9P97762 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
rp9P97762 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
rp9P97762 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
rp9P97762 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
rp9P97762 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
rp9P97762 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
rp9P97762 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
rp9P97762 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
rp9P97762 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
rp9P97762 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
rp9P97762 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
rp9P97762 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
rp9P97762 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
rp9P97762 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms