Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis3P97368 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Meis3P97368 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Meis3P97368 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis3P97368 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis3P97368 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis3P97368 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Meis3P97368 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis3P97368 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms