Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps29P62274 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rps29P62274 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps29P62274 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps29P62274 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps29P62274 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rps29P62274 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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