Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smg6P61406 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smg6P61406 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smg6P61406 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smg6P61406 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smg6P61406 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Smg6P61406 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Smg6P61406 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smg6P61406 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smg6P61406 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smg6P61406 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smg6P61406 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smg6P61406 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smg6P61406 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smg6P61406 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smg6P61406 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms