Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrp1P56183 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1P56183 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp1P56183 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms